行政事业单位资产清查工作的内容主要包括基本情况清理、账务清理、财产清查、损益认定、资产核实和完善制度等。
基本情况清理。单位基本情况清理是做好资产清查工作的前提和基础。在资产清查工作中，行政事业单位应当依据国家人事、编制等部门批准单位成立的文件，认真做好本部门和本单位对所属单位户数、编制和人员状况等基本情况的全面清理，确定基本清查单位，明确工作范围。
账务清理。账务清理是指对行政事业单位的各种银行账户、会计核算科目、各类库存现金和有价证券，以及对行政事业单位的各项内部资金往来等基本财务情况进行全面核对和清理，保证行政事业单位账证相符、账账相符。
财产清查。财产清查是对单位的各项资产和收支情况进行全面的清理、核对和查实，主要包括对行政事业单位的固定资产、流动资产、对外投资、无形资产和负债，以及单位的经费渠道和支出情况等的清查。要重点做好各类应收及预付账款、各项对外投资、账外资产的清理和核查，以及做好单位有关担保、出租资产等事项的清理。
损益认定。损益认定是财政部门在行政事业单位进行基本情况清理、账务清理、资产清查的基础上，依据国家有关政策和规定，对清理出来的各项资产盘盈、盘亏、资产损失和资金挂账进行认证。
资产核实。资产核实是指对行政事业单位资产及债权债务进行清查登记和对收人、支出情况进行详细核对的基础上，对各项资产盘盈、盘亏财产损失和资金挂账进行核实清理，对清出的问题按规定进行必要账务处理，以重新确认行政事业单位占用的各项资产价值总额和净资产的真实状况。
完善制度。完善制度是指针对资产清查工作中发现的问题，进行全面总结、认真分析，提出相应整改措施和实施计划，建立健全资产管理制度。
概念；资产清查是指以实地盘点、核对往来等方法，查明经济主体占有资产实有数额的活动。目的是摸清企业的家底，为企业评估管理提供基础数据。
财产清查是一项涉及面广、工作量大的工作，为了保证财产清查工作的质量，提高工作效率，达到财产清查的目的，确定各项财产清查的方法是很有必要的。
一、实物的清查
财产清查的重要环节是盘点财产物资的实存数量，为使盘点工作顺利进行，应建立一定的盘存制度。一般说来，财产物资的盘存制度有两种：永续盘存制和实地盘存制。
（一）确定财产物资账面结存的方法
1.永续盘存制。永续盘存制亦称账面盘存制。采用这种方法，对平时各项财产物资的增加数和减少数，都要根据会计凭证连续记入有关账簿，并且随时结出账面余额，其公式为：
账面期末余额=账面期初余额+本期增加额-本期减少额
这种盘存制度要求财产物资的进出都有严密的手续，便于加强会计监督；在有关账簿中对财产物资的进出进行连续登记，且随时结出账面结存数，便于随时掌握财产物资占用情况及其动态，有利于加强财产物资管理。其不足之处在于账薄中记录的财产物资的增减变动及结存情况都是根据有关会计凭证登记的，可能发生账实不符的情况。因此，采用永续盘存制，需要对各项财产物资定期进行财产清查，以查明账实是否相符，以及账实不符的原因。
2.实地盘存制。同永续盘存制相对应的是实地盘存制。采用这种方法，平时只根据会计凭证在账簿中登记财产物资的增加数，不登记减少数，到月末，对各项财产物资进行盘点，根据实地盘点确定的实存数，倒挤出本月各项财产物资的减少数，其公式为：
本期减少数=账面期初余额+本期增加数-期末实际结存数
根据以上计算倒挤出的本期减少数，再登记有关账簿。所以，每月末对各项财产物资进行实地盘点的结果，是计算、确定本月财产物资减少数的依据。
采用这种方法，工作简单、工作量少，但各项财产物资的减少数没有严格的手续，不便于施行会计监督。倒挤出的各项财产物资的减少数中成份复杂，除去正常耗用的外，可能还有毁损和丢失的。所以，除非特殊原因，一般情况下不宜采用。
（二）清查财产物资的方法
不同品种的财产物资，由于其实物形态、体积重量、码放方式不同，采用的清查方法也不同，一般有实地盘点和技术推算盘点两种。
1.实地盘点。实地盘点是指在财产物资堆放现场进行逐一清点数量或用计量仪器确定实存数的一种方法。这种方法适用范围广，要求严格，数字准确可靠，清查质量高，但工作量大。如果事先按财产物资的实物形态进行科学的码放，如五五排列、三三制码放等，都有助于提高清查的速度。
2.技术推算盘点。技术推算盘点是利用技术方法，如量方计尺等对财产物资的实存数进行推算的一种方法。这种方法适用于大量成堆，难以逐一清点的财产物资。
为了明确经济责任，进行财产物资的盘点时，有关财产物资的保管人员必须在场，并参加盘点工作。对各项财产物资的盘点结果，应逐一如实地登记在"盘存单"上，并由参加盘点的人员和实物保管人员共同签章生效。"盘存单"是记录各项财产物资实存数量盘点的书面证明，也是财产清查工作的原始凭证之一。
盘点完毕，将"盘存单"中所记录的实存数额与账面结存余额核对，发现某些财产物资账实不符时，填制"实存账存对比表"，确定财产物资盘盈或盘亏的数额。"实存账存对比？quot；是财产清查的重要报表，是调整账面记录的原始凭证，也是分析盈亏原因、明确经济责任的重要依据，应严肃认真地填报。